昆明动物研究所公共技术中心是研究所为加强技术平台的建设，提高科研设备共享率和使用率，在2011年成立的公共技术支撑实体。中心整合了所公共支撑平台包括中心实验室、遗传资源与进化国家重点实验室、昆明灵长类研究中心、学科组的大中型仪器设备成为所级中心实验技术平台核心系统，并开放为所内外科研人员提供技术服务。

中心紧扣研究所重点发展领域与核心科研任务需求精准规划布局，以科研仪器共享和技术共享为核心，探索科研发展与协作的创新路径，秉持 “共建、共管、开放、共用” 的核心发展理念，着力打造服务本地区科学研究创新与地方社会经济协同发展的专业化实体平台。已累计为所内40多个研究组，所外70余家企事业单位提供了服务。

目前，中心在管共享设备133台/套，设备总值1.6余亿元。现有光学显微镜、流式细胞仪、电子显微镜、动物影像、质谱仪和高性能计算六大模块，并新推出了分子/细胞共享实验室供所内外科研人员使用。