1. 研究方向简介

真核细胞的进化基因组学　  旨在从分子和细胞两个层次上探讨真核细胞的结构、功能和基因、基因组在不同进化地位生物中的多样性及其进化形成的规律和机制。主要以一系列处在关键进化地位的单细胞生物（如贾第虫、眼虫类、衣藻及领鞭毛虫等）为研究对象，向前追溯到原核生物，向后扩展到多细胞生物，开展如下方面的研究：1) 真核细胞的重要结构（如核骨架、核纤层、染色质和核仁等）的多样性与进化；2）真核细胞重要功能活动机制（如细胞核分裂、蛋白质定向转运系统、糖酵解、卡尔文循环及磷脂合成途径等）的多样性与进化；3）与前二者相关的重要基因、基因家族、功能途径基因群和亚基因组（如核仁基因组）的多样性与进化问题; 4）从进化基因组学的角度研究有害生物（如“水华”蓝藻、恶性寄生虫如血吸虫、毛滴虫、阿米巴等）的适应性进化现象，以及基于此的特异性防治靶标的研究。本研究方向为遗传资源与进化国家重点实验室的重要组成部分。

2. PI 个人简介

文建凡

现为中科院昆明动物研究所研究员、博士生导师，学科带头人，国家重点实验室副主任。

　  1986. 7于湖南师范大学生物系获理学学士； 1989. 7于中科院昆明动物研究所获细胞生物学硕士; 1996. 7于中科院昆明动物研究所获动物学博士。

长期从事细胞生物学、生物化学、分子生物学、原生生物学、微生物学等与进化生物学的交叉学科研究。主要在细胞和分子两个层次上研究真核细胞的结构、功能机制和基因、基因组在不同进化地位生物（特别是低等单细胞生物类）中的多样性及它们的进化形成的规律和机制，探讨真核细胞的进化如何为后续生物多样性和复杂性的大发展提供前提基础的。近年来还从进化基因组学的角度开展有害生物（如“水华”蓝藻、恶性寄生虫等）的特异性分子防治靶标的研究。已主持了来自国家、中科院和云南省等的科研项目 16 项，参加 6 项。在包括“ Mol. Biol. Evol. ”、“BMC Evol. Biol.”、“ Biol. Cell ”、“ Gene ”、“ Phycologia ”、“ Cell Res. ”等 SCI 刊物在内的国内外核心刊物上发表论著40 余篇。有3项研究成果获得省部级科技成果奖，并获国务院特殊津贴和“云南省青年科技奖”等个人奖励。现担任中国细胞生物学学会理事，中国原生动物学会理事，云南省细胞生物学会理事长。

3. 在研项目

1）科技部973项目课题 (2007CB815705)（主持）“基因和基因家族/群功能的选择和进化” 2007-2012

2）国家基金委重点项目（30830018）（主持）极原始的原生动物－－贾第虫的核仁功能基因组与核仁的起源进化探讨

3）中科院知识创新工程重要方向项目（KSCX2-YW-R-091）（主持）“两类原生生物的分子系统学研究”

4) 云南省应用基础研究计划重点项目（2006C0014Z）(主持) “血吸虫防治的分子生物学研究”

5) 国家基金委创新研究群体项目 (30021004) （参加）“分子进化与进化基因组学”

6) 国家基金委优秀重点实验室研究项目（30623007）（参加）“几个重要基因和基因家族及其功能的进化”

4．实验室成员

在读硕士生：申浩 阳春林 江永海 潘绍云 汪德勇 唐丹 倪亭 程菁菁 邹勇

在读博士生：徐健 张玉娟 冯金梅　　 

客座研究人员：冯宪敏

固定人员：田海峰(助研） 陈兵(助研)

5. 近五年发表的代表性论文

1)　　　 Zhang Y.-J., Tian H.-F., Wen J.-F.* 2009. The evolution of YidC/Oxa/Alb3 family in the three domains of life: a phylogenomic analysis. BMC Evol Biol. 9: 137.

2)　　　 Sun G.-L., Shen W., Wen J.-F.* 2008. Triosephosphate isomerase genes in two trophic modes of euglenoids (euglenophyceae) and their phylogenetic analysis. J Eukaryot Microbiol. 55(3):170-7.

3)　　　 Dong J.-H., Wen J.-F.* , Tian H.-F. 2007. Homologs of eukaryotic Ras superfamily proteins in prokaryotes and their novel phylogenetic correlation with their eukaryotic analogs. Gene 396: 116-124.

4)　　　 Xin D.-D., Wen J.-F.* , He D. & Lu S.-Q. 2005. Identification of a Giardia krr1 homolog gene and the secondarily anucleolate condition of Giaridia lamblia . Mol. Biol. Evol. 22(3): 391-394.

5)　　　 He D., Wen J.-F.* , Chen W.-Q,, Lu S.-Q. & Xin D.-D. 2005. Identification, Characteristic and Phylogenetic Analyses of Type II DNA topoisomerase Gene in Giardia lamblia. Cell Res. 15(6): 474-482.

6)　　　 Shen W., Wen J.-F.* , Sun G.-L. and Lu Y. 2005. Identification of TIM genes from Microcystis (Cyanobacteria: Chroococcales) and theoretic analyses of the potential of cyanobacterial TIM as a target for designing specific inhibitors.” Phycologia 44(4): 447-452.

7)　　　 He D., Dong J.-H., Wen J.-F.* , Xin D.-D. & Lu S.-Q. 2005. Phylogenetic Positions of Several ‘Amitochondriate' Protozoa ---- Evidence from phylogenetic analysis of DNA topoisomerase II. Sci. China (series C) 48 (6): 565-573.

8)　　　 Dong J.-H, Wen J.-F.* , Xin D.-D & Lu S.-Q 2004. Evolutionary status of Entamoeba . Chinese Sci. Bull . 49(17): 1847-1853.

6．获奖情况

1) 2006年，“核骨架与核纤层的起源进化研究”获“云南省自然科学奖”（二等奖）；

2) 2000年，“中国蓝氏贾第虫虫株分离培养、基因型及其细胞核研究”获“北京市科学技术进步奖”（二等奖）；

3) 1999年，“涡鞭毛虫（甲藻）及其进化地位的研究”获“云南省自然科学奖”（二等奖）；