家猪毛色表型常作为易察觉的外型特征，在品种选育中起重要作用。六白（四蹄、头和尾尖白色）是一种家猪中常见的毛色类型，在不同的欧亚家猪品种中均有发现。前人的研究揭示欧洲家猪出现的六白毛色与MC1R基因的插入突变紧密相关，但对有着不同驯化起源的中国家猪来说，这一表型的形成机制至今并不清楚。在滇南小耳猪中，六白毛色占有很高比例，并且大量个体出现了不完全六白的特征，给该家猪品种的选育过程带来了困难。 

　　为了解决这一科学问题，我所的张亚平院士课题组利用二代测序技术，对17头具有六白毛色表型和14头全黑表型的滇南小耳猪进行了全基因组测序，利用比较基因组学的分析手段，并结合大规模群体基因分型验证，从分子层面揭示了调控滇南小耳猪六白毛色的遗传机制。研究结果显示，滇南小耳猪的六白毛色并非由于MC1R基因的突变导致，而是受到多个基因共同调控的复杂性状；CNTLN、PINK1和EDNRB三个基因座的变异共同解释了滇南小耳猪群体中约20%的毛色表型变异；在六白个体中，EDNRB基因上有一段跨物种保守的CEBPB识别motif发生突变，可能导致了基因表达的改变。该研究拓展了对家猪驯化过程中毛色变异调控机制的认识，并且对滇南小耳猪的选育具有重要指导意义。 

　　目前这一研究成果已发表于学术期刊Scientific Reports上（http://www.nature.com/articles/srep27534），我所博士研究生吕梦蝶和韩徐曼为共同第一作者，张亚平院士和谢海兵博士为共同通讯作者。 

　　该项研究工作得到了国家自然科学基金面上项目、科技部973计划等项目的支持。